Cada grupo deve defender o projeto abaixo:

1. Objetivo: caracterizar a mudança da expressão gênica no cérebro sob efeito de estresse.
   Objetivos específicos:
   a) submeter camundongos a tratamento de estresse por cinco dias, aprisionando-os por duas horas todos os dias dentro de tubos falcon de 50 mL.
   b) isolar o hipotálamo desses animais e de animais controle e isolar mRNA
   c) gerar bibliotecas de cDNA e isolar 20 mil ESTs de cada biblioteca (apenas a EST 5')
   d) verificar as ESTs que formam clusters e usar o software PHRAP para gerar contigs das mesmas
   e) anotar esses contigs e singlets (ESTs únicas) com o software BLAST pesquisando homologia em bancos de dados
   f) selecionar as ESTs com freqüência diferente nas duas bibliotecas
   g) validar a expressão desses genes

2. Objetivo: o mesmo do grupo 1
   Objetivos específicos:
   a) idem grupo 1
   b) idem grupo 1
   c) obter um chip de oligonucleotídeos contendo 10 mil genes de camundongo
   d) realizar experimento de microarranjo comparando as duas preparações de mRNA (controle e estresse)
   e) validar a expressão dos genes diferencialmente expressos

3. Objetivo: o mesmo do grupo 1
   Objetivos específicos:
   a) idem grupo 1
   b) idem grupo 2
   c) desenhar iniciadores específicos para genes induzidos por exposição de ratos a odor de gato (dados já publicados)
   d) comparar a expressão desses genes nas duas amostras (controle e estresse)
   
4. Objetivo: mesmo que o grupo 1
   Objetivos específicos:
   a) idem grupo 1
   b) isolar o hipotálamo desses animais e purificar proteínas nucleares
   c) comparar o perfil de géis bidimencionais das duas amostras (controle e estresse)
   d) sequenciar por espectrometria de massa os "spots" diferentes
   e) comparar com o PM exato de produtos protéicos do genoma do camundongo para identificar as proteínas diferencialmente expressas
   f) validar através de outra técnica

5. Objetivo: descobrir genes envolvidos na resistência de soja ao fungo que produz a ferrugem
   Objetivos específicos:
   a) isolar fungo de cultivares infectados
   b) submeter cultivares de soja a infecção com fungo em casa de vegetação
   c) extrair o RNA de folhas após 48 horas de infecção e de folhas controle e purificar mRNA
   d) idem grupo 1
   e) idem grupo 1
   f) idem grupo 1
   g) idem grupo 1

6. Objetivo: o mesmo do grupo 5
   Objetivos específicos:
   a) idem grupo 5
   b) idem grupo 5
   c) idem grupo 5
   d) idem grupo 1 utilizando as 371817 ESTs presentes no banco de dados dbEST
   e) imprimir uma lâmina de microarranjo com os clones que produzem as ESTs singlets e com um representante de cada contig.
   f) idem grupo 2 objetivo "d"
   g) idem grupo 2 objetifo "e"

7. Objetivo: o mesmo do grupo 5
   Objetivos específicos:
   a) idem grupo 5
   b) idem grupo 5
   c) idem grupo 5
   d) produzir blbiliotecas SAGE a partir das duas amostras (controle e estresse)
   e) identificar as Tags diferencialmente expressas
   f) mapear as Tags em genes de soja descritos (1162 genes)
   g) validar através de outra técnica

8. Objetivo: o mesmo do grupo 5
   Objetivos específicos:
   a) idem grupo 5
   b) idem grupo 5
   c) comparar o perfil de géis bidimencionais das duas amostras (infectado e controle)
   d) sequenciar O N terminal dos "spots" diferentes pela técnica de Edman
   e) identificar por similaridade com bancos de dados o possível gene, incluindo na pesquisa seqüências do projeto genoma em progresso (total de 741.194 seqüências), utilizando para este fim o programa tBLASTn
   f) validar a expressão diferencial utilizando mRNA cedido pelo grupo 5