Paper H3

• H3 fosforilada em resposta a MAP quinases (onda de indução de c-fos)
• H3 K9 e K14 são acetiladas antes de ativação de transcrição
• Metilação de K9 precede inativação. Fosforilação de serina 10 é meio antagônica. Mas as duas modificações não são ativadoras? Talvez ocorram em nucleossomos diferentes? Parece que a fosforilação atrai acetilases em leveduras. Parece que isso é comum na ativação de genes induzidos por MAP quinases.
• O promotor de RARgama já está acetilado, mas responde a MAP quinases sendo fosforilado em H3.
• Heat Shock em dme não mudou distribuição de acetilações, mas a fosforilação de H3 em serina 10 ficou reduzida a genes induzidos por choque térmico. E genes que são reprimidos tem desfosforilação de H3.
• Foi visto que promotores TATA-less não são fosforilados em H3, mas os dependentes de TATA são. Acetilação em politênicos é nas interbandas, sujando o papel dela na transcrição em dme. Se mutar a fosfatase em dme, não apaga a fosforilação durante choque térmico e os genes dali permanecem ativos!
• Como coadunar fosforilação de H3 com mitose e ativação?

RNA pol paper

• Os nucleossomos são um obstáculo para a transcrição. As mudanças do empacotamento são chamadas de remodelamento. Há dois mecanismos, a movimentação do DNA sobre o nucleossomo ou a saída intermitente de H2A e H2B (os dímeros mais externos). Durante essa modificação (heminucleossomos) um grupo SH de H3 fica exposto.
• Será que a PolII faz diferenças na superestrutura da cromatina já que ela é um potente remodelador? Um exemplo é no cluster de betaglobinas, onde transcritos intergênicos aparecem talvez para abrir a cromatina!
• O nucleossomo parece ser transferido diretamente para upstream da polimerase que passa, pq se eles estão em lugares específicos, eles aparecem em outros lugares específicos (como ter tanta memória?). Além disso, se a Pol passar rápido ele desmontaria, logo de vê mesmo é ser transferido
• Dois tipos de complexo de remodelamento parecem fazer bolhas
• É conhecido que Pol II para logo depois de começar e isso deve ser o primeiro nucleossomo. Existe um fator FACS que facilita a transposição.
• Isso é muito importante no controle da elongação, certo?