Acesso remoto a servidores e introdução ao linux

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Sistema operacional:

1. CentOS (distribuição gratuita do RedHat Enterprize )
2. Fedora
3. Ubuntu

Como se conectar a partir de Windows:

1. Troca de arquivos: Secure Shell
2. Conexão direta SSH: Putty

Comandos Linux:

1. Veja aqui

Entrando numa conta no servidor:

2. Abra o programa Putty
3. Complete o campo Host name com pinguim.fmrp.usp.br e mude Protocol para SSH e porta para 223
4. Complete o campo Saved sessions com pinguim
5. Clique o botão Save
6. De agora em diante clicando pinguim o terminal abre
7. Logue como ufrn1, pegue a senha na aula
8. Vamos exercitar alguns comandos
1. $ mkdir seunome (não use acentos, maiúsculas, espaços)
2. $ ls – lista o conteúdo
3. $ cd seunome
4. $ mkdir teste
5. $ ls
6. $ cd .. (olha os dois pontos ai gente!!!)

Editor de texto online (vi):

9. $ ls /home/treinamento
10. $ more /home/treinamento/lyrics
11. $ cd seunome
12. $ cp /home/treinamento/lyrics . [opag] pergunte na aula sobre o “dedinho do bioinformata”
13. $ ls
14. Nesse momento vc já ta se virando bem, falta só um poder: editar o aquivo lá no servidor
15. $ vi lyrics
16. Para entrar no INSERT MODE digite “i”
17. Usando aas setinhas navegue e traduza para português
18. Pra salvar tecle ESC + dois pontos (:) e x!
19. $ more lyrics
20. $ mv lyrics poesia
21. Belo treino!
22. Agora pegue uma seqüência de mioglobina no NCBI (veja como na aula)
23. Send to File
24. Abra com bloco de notas
25. Digite no terminal: $ vi mioglobina
26. Copie do bloco de notas
27. Botão da direita no terminal cola!!!!!!!!
28. Sai como antes EXC + : + x!
29. Agora vc sabe tudo!

O melhor de todos os comandos: grep

1. $ ls /home/treinamento/blast_aula/454data
2. $ more /home/treinamento/blast_aula/454data/tumor.seq (aperte “q” para sair)
3. $ cat /home/treinamento/blast_aula/454data/tumor.seq | grep ">" | more
4. $ cat /home/treinamento/blast_aula/454data/tumor.seq | grep ">" -c
5. Pronto agora vc sabe contar seqüências num arquivo

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